安装

在 DeepSeek Harness 里通过 dsh-market 安装

dsh plugin --profile web add dshmarket

或使用命令行

dsh plugin --profile web add github:Yijian-quiet/dsh-mol#path:/dsh-ui

装任何插件都等于在你的机器上跑第三方代码，权限和你本人一样大——能读你的文件、用你的凭据、访问网络。请先审阅源码，并尽量锁定 commit（github:owner/repo#sha）。

截图

README

给 DeepSeek Harness 的化学工作台：聊天照常，输入框旁多一个「工作台」按钮，点开一个可拖动、可最大化的浮层，里面三个页签：

输入框左侧 [🧪 工作台] → 浮层（不占主区域，聊天不被顶掉）
   ├─ 画板    Ketcher 全功能画板（浏览器本地 wasm 渲染，不经后端）
   ├─ 分析    本地 RDKit 现算：性质 / 类药性 / 结构警报 / 骨架 / 子结构 / 相似度 / 批量
   └─ 逆合成  多步路线规划（后端可插拔，默认 Retro*；没装好就如实说没装好）
                 ↓ 「插入到对话」/「交给小深」
           结构 + 任务写进**当前会话**的输入框 → 你补一句就发

工作台 · 分析页签

交互设计（2026-09-25 按用户反馈改了两轮）

第一版是错的：把工作台注册成 main 面板 → 点开就占掉整个主区域 → 聊天看不见了，结构被插进一个"你看不到的会话"里。用户原话："有点不太合理"。

第二版也不对：面板底部做了个"结构预览条"，在画板里再画一张小图。用户原话："预览是在画布里的，这本身没什么用"。

现在：聊天保持原样，工作台在旁边；图交给 agent 在回复里画。

结构图出现在聊天里，不在工作台里（但工作台里有一张缩略图）

这两件事不一样，别混：

工作台里的缩略图：界面的一部分，作用是"确认我算的是不是这个分子"。用 Ketcher 的 generateImage() 在浏览器本地渲（不联网、不经后端）
回复里的结构图：由 agent 调 read_image 内联画出，旁边是它对这分子的解释

实测：DSH 的内联图卡硬门控于 read_image（源码写死 if (call?.name !== "read_image") return null），MCP 工具返回的图片内容块拿不到图卡， present 也只产出交付卡片。所以"配图"这件事只能在 agent 侧做，插件不掺和。

插入的文本保持干净

写进输入框的只有结构和任务，例如：

CCO 请算一下这个分子的性质（分子式、MW、logP、TPSA、HBD、HBA、环数）：CCO

不夹带任何内部提示（曾经塞过 [产物目录：…]，用户明确要求去掉）。

为什么宿主半边必须存在

两个理由，缺一不可：

Ketcher 必须同源：客户端用 <iframe> 嵌它，然后读 iframe.contentWindow.ketcher.getSmiles()。跨源会被同源策略挡掉 —— 不能让用户另起一个静态服务，必须由插件在 DSH 这个源上提供
即时数字必须本机现算：如果算个分子量都要绕一圈问模型，这就不是工作台，只是个提示词发射器。宿主半边进程里 fork 一个 python（python3 -m chemcore.cli）就够了 —— 实测冷启动含 RDKit 导入约 0.2 秒

配色不要依赖主题变量

踩过：早先用 var(--dsh-surface) + color: inherit，深色主题下变成"浅色字 + 白底"，文字直接看不见。Ketcher 本身就是浅色画布，所以整窗固定浅色 + 显式色值，两种主题下都清晰。

安装

1) 拿 Ketcher 构建

Ketcher 的独立构建有 116 MB，不能进 git。一条命令搞定（约 35 MB 下载）：

node scripts/fetch-ketcher.mjs          # 默认解到 <包目录>/ketcher，版本 3.18.0

宿主半边按这个顺序找它，找到一个就够，多数情况什么都不用配：

配置 ketcherDir → 环境变量 CHEM_KETCHER_DIR → <包目录>/ketcher
→ <仓库根>/ketcher → ~/.cache/dsh-chem-ui/ketcher → ~/.dsh/ketcher

2) 把插件挂进 profile

dsh plugin --profile web add 'github:Yijian-quiet/dsh-mol#path:dsh-ui'

或者在本机 profile 的 cordis.patch.yml 里手写：

- insert:
    - id: chem-ui
      name: 'dsh-chem-ui'
      config:
        # ketcherDir 不写也行，会按上面的顺序自动找
        retroHome: /path/to/retro_star-master      # 逆合成后端（可选）
        # python: /path/to/python3                 # 默认 python3，需能 import rdkit
        # retroCommand: 'python3 /path/to/your_bridge.py'   # 换后端（可选）

客户端半边改动后要刷新页面才生效（第三方插件没有 HMR）。

路由（宿主半边提供，都挂在 DSH 自己的源上）

路由	作用
`GET /chem/ketcher/*`	Ketcher 静态构建（带目录穿越防护）
`POST /chem/tool`	`{op, ...}` → `python3 -m chemcore.cli` → RDKit 结果
`POST /chem/retro`	逆合成（默认转发给 `retro/retro_star_bridge.py`）
`GET /chem/status`	能力自述：RDKit 通不通、逆合成配没配、Ketcher 挂没挂

刻意避开 /api 前缀 —— 那一段是 DSH 自己的 RPC 与浏览器信任栅栏的地盘。领域错误（比如 SMILES 画错了）用 HTTP 200 + {ok:false, code} 返回：它是业务答案，不是 HTTP 故障。

验收（可自动化，不需要人盯屏幕）

dsh web --port 3081 --no-open > /tmp/chemver.log 2>&1 &   # 另起实例，别碰用户正在用的端口
NODE_PATH=<playwright 的 node_modules> \
CHEM_BASE=http://127.0.0.1:3081 \
CHEM_TOKEN=$(grep -o 'token=[^ ]*' /tmp/chemver.log | cut -d= -f2) \
CHEM_SHOTS=/tmp/chem-ui-shots \
node tests/verify-ui.cjs

26 条断言，覆盖的是交互质量而不是"元素存不存在"：

工作台打开后聊天仍可编辑（核心诉求）
三个页签都在；Ketcher 就绪
画板 →「插入到对话」文本干净（不含内部路径提示）
分析页签的数字真的是 RDKit 算的（乙醇 C2H6O / 46.069 / logP -0.0014 / TPSA 20.23）
换个分子数字跟着变（阿司匹林 C9H8O4 / 180.159）—— 防"渲染写死的假数"
坏 SMILES 给人话诊断（"环闭合标记没有配对"）
子结构匹配苯环命中
逆合成没编造路线（后端没装好时不许出现"路线 1"）且如实说明状态
关闭后浮层消失、聊天照旧

两个踩过的坑写在脚本注释里：① 全新 browser context 会弹首次配置向导，它拦截所有点击 → 必须先点掉；② 三个页签都常驻 DOM（只切 display），选择器必须挑 :visible 的那个，否则 .first() 会命中隐藏页签里的输入框。

已知限制

客户端插件改动后要刷新页面才生效
浮层尺寸固定（1060×680，可拖动/可最大化）；还没有缩放把手
分析页签是"输入框 + 按钮"，还不能直接在缩略图上点原子做选区
逆合成页签的路线展示依赖后端返回树；Retro* 每次只给 1 条最优路线

路线

性质指标：面板内直接给出分子式/MW/logP 等文本指标（已完成）
非法结构标红：画板里画错时当场用人话提示（Ketcher 侧能力）
逆合成后端跑通：Retro* 数据就位后，把路线图画出来
更多分析卡片：pKa / 构象 / 代谢位点 —— 分析页签天然是它们的家

许可

MIT

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链接

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